MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	CAGA	2	8	246	253	50 %	0 %	25 %	25 %	283777747
2	NC_013717	CGT	2	6	355	360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777747
3	NC_013717	TGA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777747
4	NC_013717	CTT	2	6	750	755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777748
5	NC_013717	CAA	2	6	809	814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777749
6	NC_013717	TGC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
7	NC_013717	GCT	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
8	NC_013717	CAC	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777749
9	NC_013717	CTG	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
10	NC_013717	CT	3	6	1130	1135	0 %	50 %	0 %	50 %	283777749
11	NC_013717	TACC	2	8	1186	1193	25 %	25 %	0 %	50 %	283777749
12	NC_013717	CCGA	2	8	1229	1236	25 %	0 %	25 %	50 %	283777749
13	NC_013717	GCC	2	6	1262	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777749
14	NC_013717	GGTGGC	2	12	1282	1293	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	283777749
15	NC_013717	CGC	2	6	1301	1306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777749
16	NC_013717	ACAG	2	8	1326	1333	50 %	0 %	25 %	25 %	283777749
17	NC_013717	CAGA	2	8	1421	1428	50 %	0 %	25 %	25 %	283777749
18	NC_013717	GC	3	6	1450	1455	0 %	0 %	50 %	50 %	283777749
19	NC_013717	CGT	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
20	NC_013717	CGT	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
21	NC_013717	GCG	2	6	2035	2040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777750
22	NC_013717	ACA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777750
23	NC_013717	ACC	2	6	2082	2087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777750
24	NC_013717	CCCT	2	8	2128	2135	0 %	25 %	0 %	75 %	283777750
25	NC_013717	GCCCC	2	10	2151	2160	0 %	0 %	20 %	80 %	283777750
26	NC_013717	TGT	2	6	2200	2205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777750
27	NC_013717	TCT	2	6	2229	2234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777750
28	NC_013717	TCG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777750
29	NC_013717	CT	3	6	2348	2353	0 %	50 %	0 %	50 %	283777750
30	NC_013717	GCTG	2	8	2637	2644	0 %	25 %	50 %	25 %	283777751
31	NC_013717	A	6	6	2709	2714	100 %	0 %	0 %	0 %	283777751
32	NC_013717	TTC	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777751
33	NC_013717	CTG	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
34	NC_013717	TG	3	6	2756	2761	0 %	50 %	50 %	0 %	283777751
35	NC_013717	CCG	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777751
36	NC_013717	GTG	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
37	NC_013717	CTGC	2	8	2896	2903	0 %	25 %	25 %	50 %	283777751
38	NC_013717	CTG	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
39	NC_013717	CGT	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
40	NC_013717	TGT	2	6	3083	3088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777751
41	NC_013717	TCG	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
42	NC_013717	CTG	2	6	3118	3123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
43	NC_013717	TGG	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
44	NC_013717	GTG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
45	NC_013717	CTG	3	9	3187	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
46	NC_013717	TGC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
47	NC_013717	TTG	2	6	3240	3245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777751
48	NC_013717	GAA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
49	NC_013717	ACC	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777752
50	NC_013717	GAA	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
51	NC_013717	GGC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777752
52	NC_013717	CTG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777752
53	NC_013717	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
54	NC_013717	AGG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777752
55	NC_013717	AGC	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777753
56	NC_013717	CGG	2	6	3686	3691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777753
57	NC_013717	GCCT	2	8	3710	3717	0 %	25 %	25 %	50 %	283777753
58	NC_013717	GTT	2	6	3718	3723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777753
59	NC_013717	GCC	2	6	3905	3910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777753
60	NC_013717	TCCG	2	8	4336	4343	0 %	25 %	25 %	50 %	283777754
61	NC_013717	GCC	2	6	4378	4383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777754
62	NC_013717	AGA	2	6	4473	4478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777754
63	NC_013717	GCA	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777754
64	NC_013717	TCT	2	6	4577	4582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777754
65	NC_013717	TCA	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777754
66	NC_013717	A	6	6	4588	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	283777754
67	NC_013717	TCG	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777754
68	NC_013717	CTT	2	6	4634	4639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777754
69	NC_013717	TGT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777755
70	NC_013717	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777755
71	NC_013717	T	6	6	5045	5050	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
72	NC_013717	TCCCC	2	10	5066	5075	0 %	20 %	0 %	80 %	283777755
73	NC_013717	TAA	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777755
74	NC_013717	T	9	9	5108	5116	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
75	NC_013717	TCT	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777755
76	NC_013717	TATT	2	8	5167	5174	25 %	75 %	0 %	0 %	283777755
77	NC_013717	T	7	7	5177	5183	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
78	NC_013717	TA	3	6	5193	5198	50 %	50 %	0 %	0 %	283777755
79	NC_013717	A	6	6	5198	5203	100 %	0 %	0 %	0 %	283777755
80	NC_013717	A	8	8	5214	5221	100 %	0 %	0 %	0 %	283777756
81	NC_013717	A	6	6	5245	5250	100 %	0 %	0 %	0 %	283777756
82	NC_013717	T	7	7	5275	5281	0 %	100 %	0 %	0 %	283777756
83	NC_013717	GT	3	6	5302	5307	0 %	50 %	50 %	0 %	283777756
84	NC_013717	TGT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777756
85	NC_013717	ATG	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777757
86	NC_013717	GACA	2	8	5592	5599	50 %	0 %	25 %	25 %	283777757
87	NC_013717	CTGT	2	8	5602	5609	0 %	50 %	25 %	25 %	283777757
88	NC_013717	T	6	6	5632	5637	0 %	100 %	0 %	0 %	283777757
89	NC_013717	AAT	2	6	5677	5682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777757
90	NC_013717	T	6	6	5747	5752	0 %	100 %	0 %	0 %	283777758
91	NC_013717	TCC	2	6	5758	5763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283777758
92	NC_013717	ACA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777758
93	NC_013717	ATG	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777758
94	NC_013717	TCCT	2	8	5829	5836	0 %	50 %	0 %	50 %	283777758
95	NC_013717	CTG	2	6	5858	5863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
96	NC_013717	CTG	2	6	5890	5895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
97	NC_013717	AAT	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777758
98	NC_013717	CAG	2	6	5920	5925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777758
99	NC_013717	CTG	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
100	NC_013717	CTG	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
101	NC_013717	CAT	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777758
102	NC_013717	CTG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
103	NC_013717	CAC	2	6	6150	6155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777758
104	NC_013717	TGG	2	6	6238	6243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777758
105	NC_013717	TG	3	6	6379	6384	0 %	50 %	50 %	0 %	283777758
106	NC_013717	CA	3	6	6391	6396	50 %	0 %	0 %	50 %	283777758
107	NC_013717	CTG	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
108	NC_013717	TGGCC	2	10	6616	6625	0 %	20 %	40 %	40 %	283777758
109	NC_013717	TGGC	2	8	6638	6645	0 %	25 %	50 %	25 %	283777758
110	NC_013717	CA	3	6	6853	6858	50 %	0 %	0 %	50 %	283777758
111	NC_013717	CAG	2	6	6874	6879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777758
112	NC_013717	TGA	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777758
113	NC_013717	GAAC	2	8	6930	6937	50 %	0 %	25 %	25 %	283777758
114	NC_013717	GAAT	2	8	6965	6972	50 %	25 %	25 %	0 %	283777759
115	NC_013717	GTC	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
116	NC_013717	ACC	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
117	NC_013717	GTG	2	6	7195	7200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
118	NC_013717	GTG	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
119	NC_013717	GCG	2	6	7276	7281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
120	NC_013717	ACC	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
121	NC_013717	GTG	2	6	7309	7314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
122	NC_013717	GCG	2	6	7333	7338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
123	NC_013717	ACC	2	6	7353	7358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
124	NC_013717	GTG	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
125	NC_013717	GGC	2	6	7392	7397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
126	NC_013717	TGC	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
127	NC_013717	TGG	2	6	7529	7534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
128	NC_013717	TC	3	6	7538	7543	0 %	50 %	0 %	50 %	283777759
129	NC_013717	TCA	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777759
130	NC_013717	ACC	2	6	7572	7577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
131	NC_013717	GTG	2	6	7585	7590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
132	NC_013717	TGC	2	6	7735	7740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
133	NC_013717	CAT	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777759
134	NC_013717	GTG	2	6	7804	7809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
135	NC_013717	G	7	7	7918	7924	0 %	0 %	100 %	0 %	283777759
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257	NC_013717	A	6	6	14829	14834	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
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261	NC_013717	A	8	8	14987	14994	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
262	NC_013717	GTT	2	6	15005	15010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777764
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264	NC_013717	GGA	2	6	15104	15109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777764
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